Les antibiotiques laissent des cicatrices durables sur le microbiome intestinal

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Même un seul traitement antibiotique peut fondamentalement modifier le microbiome intestinal d’une personne pendant des années, selon une étude révolutionnaire portant sur près de 15 000 adultes en Suède. Cette recherche met en évidence les conséquences à long terme de l’utilisation d’antibiotiques au-delà de leur objectif immédiat de lutte contre les infections.

L’impact durable des antibiotiques

L’étude, publiée dans Nature Medicine, a croisé des échantillons de selles avec un registre national des médicaments pour comparer les bactéries intestinales chez les personnes ayant pris des antibiotiques au cours des huit dernières années par rapport à celles qui n’en avaient pas pris. Les résultats ont été frappants : les personnes qui avaient utilisé des antibiotiques avaient beaucoup moins de diversité microbienne dans leurs intestins. Un intestin sain contient généralement environ 350 espèces bactériennes uniques, mais l’exposition aux antibiotiques a réduit ce nombre, l’ampleur de l’impact variant en fonction du médicament spécifique utilisé.

Quels antibiotiques causent le plus de dégâts ?

Certains antibiotiques étaient bien plus perturbateurs que d’autres. La clindamycine, souvent prescrite pour les infections cutanées et dentaires, a été la plus dommageable, liée à une perte moyenne de 47 espèces bactériennes par cure. Les fluoroquinolones (pour les infections urinaires et respiratoires) et la flucloxacilline (utilisée contre le Staphylococcus aureus ) ont également entraîné des réductions significatives de la diversité, mais dans une moindre mesure. La pénicilline V, un antibiotique courant en Suède, a eu le plus faible impact, modifiant seulement 29 espèces.

Ces résultats sont importants car des études antérieures ont établi un lien entre la diminution de la diversité intestinale et des problèmes de santé chroniques comme l’obésité, le diabète de type 2 et les maladies inflammatoires de l’intestin. Bien que les mécanismes exacts soient encore à l’étude, la perte de bactéries bénéfiques peut perturber des processus métaboliques cruciaux.

La récupération est lente et pourrait ne jamais être complète

L’étude a révélé que le microbiome présentait la récupération la plus rapide au cours des deux premières années suivant l’utilisation d’antibiotiques. Cependant, le taux de guérison a considérablement ralenti par la suite, ce qui suggère que les dommages pourraient ne pas être entièrement réversibles. Même un seul traitement antibiotique pris des années auparavant pourrait encore affecter la composition des bactéries intestinales.

Pourquoi cela se produit et ce que cela signifie

La nature à large spectre de médicaments comme la clindamycine et les fluoroquinolones, qui tuent un plus large éventail de bactéries, et leur capacité à atteindre des concentrations élevées dans le côlon contribuent probablement à leurs effets graves. Étonnamment, la flucloxacilline, une pénicilline à spectre étroit, a également eu un impact substantiel, potentiellement en raison de ses modes d’absorption et d’excrétion uniques.

Les chercheurs soulignent que les antibiotiques restent essentiels pour traiter les infections graves. Comme le note un expert : « Les antibiotiques ne sont rien de moins qu’un médicament miracle… ils sont absolument nécessaires dans certains cas. » Cependant, l’étude souligne la nécessité de pratiques de prescription prudentes et d’une compréhension plus approfondie des conséquences à long terme de l’utilisation d’antibiotiques.

Les preuves suggèrent que même une seule cure d’antibiotiques peut remodeler le microbiome intestinal pendant des années, soulignant l’importance d’utiliser ces médicaments puissants uniquement lorsque cela est vraiment nécessaire.